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基于高光譜成像和機(jī)器學(xué)習(xí)的遺傳和表型相似玉米品種種子真實(shí)性檢測模型

2022/9/15
品種真實(shí)性和純度是影響產(chǎn)量的玉米種子品質(zhì)的重要指標(biāo)。然而,品種真實(shí)性的檢測方法耗時(shí)、昂貴、需要大量培訓(xùn)或在此過程中破壞種子。在這里,我們提出了一種準(zhǔn)確、高通量、低成本和無損的篩選品種真實(shí)性的方法,該方法使用種子表型數(shù)據(jù)和機(jī)器學(xué)習(xí)來區(qū)分遺傳和表型相似的種子品種。具體來說,我們獲得了京科968和其他9個(gè)近緣品種(非京科968)的種子形態(tài)和高光譜反射率圖像數(shù)據(jù)。然后,我們根據(jù)表型成像數(shù)據(jù)比較了三種常見機(jī)器學(xué)習(xí)算法在區(qū)分這些品種方面的穩(wěn)健性。

品種真?zhèn)螜z測結(jié)果可視化。利用Tu等人[3]基于RGB圖像的模型和VGG16網(wǎng)絡(luò)對目標(biāo)品種京科968的9個(gè)遺傳和表型相似的玉米品種(非京科968)進(jìn)行了測試。。 紫色表示檢測結(jié)果為非晶科968。藍(lán)色表示檢測結(jié)果為晶科968

我們的研究結(jié)果表明,高光譜成像 (HSI) 結(jié)合多層感知器 (MLP) 或支持向量機(jī) (SVM) 模型可以將京科 968 與僅相差兩個(gè)位點(diǎn)的品種區(qū)分開來,準(zhǔn)確率達(dá)到 99% 或更高,而機(jī)器視覺成像長度準(zhǔn)確率達(dá)到90%以上。 通過對未包含在訓(xùn)練數(shù)據(jù)中的品種進(jìn)行模型驗(yàn)證和更新,我們?yōu)榫┛?968 開發(fā)了一個(gè)真實(shí)性檢測模型,可有效區(qū)分遺傳相似和相距較遠(yuǎn)的品種。

不同品種玉米種子的胚芽和非胚芽表面。 最上面一行代表玉米品種京科 968 的 9 個(gè)種子批次。 底行代表非京科 968類別的其他9個(gè)非目標(biāo)品種,與京科968品種遺傳相似

該策略具有廣泛應(yīng)用于內(nèi)部質(zhì)量控制或政府監(jiān)管機(jī)構(gòu)的大規(guī)模品種真實(shí)性檢測操作或加速新品種育種的潛力。此外,它可以很容易地?cái)U(kuò)展到其他目標(biāo)品種和其他作物。

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